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范围广泛的疾病，主要起源于真菌，会导致蓝色云杉树上长出黄色针叶。治疗因疾病而异，但在所有情况下，预防措施都会有所帮助，例如从信誉良好的种植者那里选择蓝云杉，而不是在前几年出现黄针叶问题的地区种植。
根球菌针铸
Rhizosphaera needle cast 通过雨水或灌溉水的飞溅传播。Rhizosphaera needle cast 是一种真菌病害，会导致蓝色云杉针叶在夏季变黄，然后在秋季变成红色至紫色。受感染的针头最终会脱落。如果不加以处理，Rhizosphaera 针铸最终会杀死蓝云杉。反复使用杀真菌剂通常可以使受感染的蓝云杉恢复健康。当新的生长量达到其预期生长量的一半左右时喷洒，然后在针叶达到当年的完全生长时再次喷洒。大多数情况下重复两年；如果疾病持续存在，则需要更长的时间。
天竺葵针叶枯病
Lirula 针叶枯病通常发生在蓝云杉的下部分枝上。Lirula 针叶枯病是一种真菌病害，首先出现在两岁的针叶生长上。这些受影响的针在夏末变成黄色或棕色。第二年，被感染的针头上长出了一条黑线。在随后的几年里，这些针仍然附着但会变成紫色到灰色。当新生长量约为当年预期生长量的一半时，可以通过向树木喷洒含有活性成分百菌清或波尔多混合物的杀真菌剂来预防蓝云杉的针叶枯病。一个月后再次喷洒，并在接下来的两年内重复喷洒。
云杉针锈病
Chrysomyxa 是导致云杉针锈病的真菌。云杉针锈病是一种真菌病害，会影响当年的生长。症状包括针尖变黄。到仲夏时节，受感染的针头会长出橙色或白色的小物。这些生长物含有橙色的真菌孢子。 9月变色针脱落。云杉针锈通常并不严重，通常只会损害蓝云杉的审美价值。修剪受感染的树枝以帮助控制其传播。
溃疡病菌
对修枝剪进行消毒，以免传播 Cytospora 溃疡病。Cytospora canker 不仅影响云杉针叶，而且最终可以逐条杀死蓝色云杉树枝。蓝云杉感染 Cytospora canker 的症状始于树的底部树枝。受影响肢体上的针会变成黄色或棕色，并可能脱落。这种疾病没有化学控制。受感染的树木应移除受影响的树枝，切回下一个活芽或主干。施肥以刺激新的生长。
